הבקר באופניים חשמליים פועל כמו המוח של המערכת: הוא מקבל אותות של ידית התאוצה והחיישנים, מתרגם אותם לפקודות למנוע, ודואג שתהיה התאמה מדויקת בין כל הרכיבים – סוללה, מנוע וצג. הבקר הוא הרכיב ששולט על זרימת החשמל מהסוללה למנוע, והוא זה שמכתיב בפועל את מהירות האופניים החשמליים ואת עוצמת ההאצה.
חשוב לבחור בקר שמתאים להספק ולמתח של הסוללה והמנוע כדי למנוע תקלות. בקר לא מתאים עלול לפגוע באופניים, ולכן אם אתם שוקלים להחליף בקר, אל תעשו את זה לבד, עדיף לפנות למתקן אופניים חשמליים מומלץ.
