בקטריה לאקווריום היא תוסף שמכיל חיידקים טובים, שעוזרים לשמור על איזון ובריאות המים באקווריום. החיידקים מפרקים פסולת כמו שאריות מזון וצואה, ומנטרלים רעלנים מסוכנים על ידי הפיכתם לחומרים פחות מזיקים לדגים. משתמשים בבקטריה בעיקר בהקמת אקווריום חדש או כדי לשמור על יציבות במערכת קיימת ולהפחית את הצורך בהחלפות מים תכופות.