משכנתא מועדפת היא מסלול מיוחד הניתן על ידי משרד הבינוי והשיכון בעזרת תעודת זכאות למשכנתא. משכנתא מועדפת מציעה ריבית של 0.5% פחות מהממוצע, ותקופת החזר של עד 30 שנה.
זכאות למשכנתא מועדפת נקבעת על ידי משרד הבינוי והשיכון בהתאם לקריטריונים כמו סטטוס משפחתי, שירות צבאי ומקום מגורים.