מבנה אנטומי היא שכבה שמפסלת את הציפורן כך שתהיה "מושלמת", כלומר שהציפורן תהיה אחידה ובלי שקעים. יישום מבנה אנטומי מחליק ומחזק את הציפורן ובכך משפר את המראה הסופי לק הג'ל.
איך מיישמים מבנה אנטומי? בעזרת ג'ל בסיס או חומרי בניית ציפורניים כמו אקריל. המטרה היא שהציפורן תהיה עבה במרכזה ותלך ותידקק כך שהיא תישאר גמישה ולא תישבר בקלות.
שימו לב, לא בכל מריחת לק ג'ל צריך לעשות מבנה אנטומי והיישום יאריך את הטיפול, שנמשך לרוב בין 30-45 דקות.