ההבדל בין חשבונית מס לחשבונית מס קבלה הוא במועד ההנפקה של כל אחת.
חשבונית מס מופקת כשהעסקה בוצעה אבל עדיין לא התקבל תשלום מהלקוח.
חשבונית מס קבלה היא מסמך שמשלב חשבונית מס וקבלה. היא מופקת כשהתשלום עבור השירות או המוצר הם מידיים. המסמך מאשר את ביצוע העסקה וגם את קבלת התשלום עבורה.